A série é um mistério religioso, acompanhando dois personagens centrais, um físico, Dr. Richard Massey (Bill Pullman), professor da universidade de Harvard cuja filha foi assassinada por satanistas, e uma freira, Josepha (Natascha McElhone), que irá atrás do Dr. Richard para tentar fazê-lo ajudá-la a investigar quais eventos contidos no Livro das Revelações virão a se tornar realidade num futuro muito próximo. Enquanto o cético Dr. Richard sempre tentou provar que todos os eventos que ocorrem na natureza poderiam ser explicados pela Ciência, Josepha vai levá-lo a uma jornada através do curioso mundo da fé, quando diversos milagres passam a acontecer e diversos sinais são enviados, mas não se sabe se são do Céu ou do Inferno. Isaiah Haden (Michael Massee), um satanista, pretende garantir que o Exército da Escuridão vença a batalha do Apocalipse, que está próxima. Enquanto isso, Dr. Richard e Josepha correrão contra o tempo a fim de evitar o fim do mundo.