A série conta a história de Diego Márquez, um menino latino de 8 anos, preocupado com a preservação da natureza e com os animais que nela vivem. Primo de Dora, personagem da série animada Dora, a Aventureira,e também de Guillermo e Isabella. Em Go Diego Go! as crianças aprendem valores de respeito e amor à natureza e aos animais.