100 anos se passaram após a subducção da placa tectônica que causou muitos estragos e deixou muitos países submersos. Para salvar os países restantes, as cidades costeiras foram lançadas nos mares e as rotas marítimas entre elas expandida. As mulheres começaram a procurar emprego neste novo ramo e as “Blue Mermaids”, aquelas que guardam o mar seguro, começaram a ser uma fonte de admiração para muitos. As amigas de infância Akeno Misaki e Moeka China querem se tornar Blue Mermaids e, juntamente com outras que compartilhavam do mesmo sonho, se matriculam no Colégio Yokosuka da Marinha.