A série mostra a história de Toha Yamashi . Órfão, Toha foi criado pelo 34º sucessor da família Togakure , Tetsuzan Yamashi, patriarca que guarda metade da inscrição que revela o esconderijo do tesouro Pako, objeto o qual ninjas de todo o mundo estão atrás. Tal tesouro concederia superpoderes a quem o descobrisse. A outra metade da inscrição está nas mãos de Oninin Dokusai e a família dos Feiticeiros. Toha seguiu a jornada de proteger Pako e a inscrição alem de acabar com alguns inimigos e conquistando aliados, do Império Ninja e acabar com a Familia de Feiticeiros comandada por Oninin Dokusai.